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2025 年 4 月,《Science Advances》(新影響因子 11.7)發(fā)表了一篇題為 “Atf3 controls transitioning in female mitochondrial cardiomyopathy as identified by spatial and single - cell transcriptomics”的研究論文[1]。
線粒體疾病(MD)是一類棘手的代謝病,由氧化磷酸化異常引發(fā),發(fā)病率高且難以。線粒體心肌病(MCM)作為其中一種,心臟受累嚴(yán)重影響患者預(yù)后,還缺乏手段。因此,探尋 MCM 從代償?shù)绞Т鷥數(shù)霓D(zhuǎn)變機(jī)制,是開發(fā)有效療法的關(guān)鍵。
研究人員分析了一名9個月大 MCM 女性患者的心室組織,運(yùn)用空間分辨轉(zhuǎn)錄組學(xué)和單核RNA 測序(snRNA-seq)技術(shù),通過蘇木精- 伊紅(H&E)染色評估組織異質(zhì)性,利用無監(jiān)督聚類分析基因表達(dá)特征,借助偽時間軌跡推斷研究細(xì)胞動態(tài)變化過程。同時,選用心臟特異性 Ndufs6 敲低的 FS6KD 小鼠模型,收集不同疾病階段雌性小鼠心臟組織進(jìn)行 snRNA-seq 分析,尋找關(guān)鍵調(diào)控基因。此外,還通過免疫染色、光隔離化學(xué)和熒光素酶報告基因?qū)嶒?yàn)等方法,驗(yàn)證關(guān)鍵基因 Atf3 的功能,構(gòu)建 Atf3 基因敲除的 FS6KD 小鼠,通過超聲心動圖、RNA 測序和蛋白質(zhì)分析等評估心臟功能和代謝變化。
空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄技術(shù)(snRNA-seq)相結(jié)合,從不同層面分析 MCM 患者心臟組織和小鼠模型,展現(xiàn)了心肌細(xì)胞在疾病進(jìn)展中的復(fù)雜變化;發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子 ATF3 在雌性 MCM 進(jìn)展中起關(guān)鍵作用,是心肌細(xì)胞狀態(tài)轉(zhuǎn)變的關(guān)鍵觸發(fā)因素;還揭示了 MCM 進(jìn)展中的性別差異,Atf3 基因敲除對雌性小鼠有心臟保護(hù)作用,雄性則無,為個性化提供了依據(jù)。另外,研究還明確了 ISRmt 的時間,在雌性 FS6KD 小鼠中,ISRmt 在疾病中期被,且發(fā)生在 Atf3 表達(dá)之后,這表明 Atf3 可能在 ISRmt 前就已啟動疾病的轉(zhuǎn)變過程。
研究終得出重要結(jié)論:MCM 患者心臟組織中的心肌細(xì)胞高度異質(zhì),從代償?shù)绞Т鷥數(shù)霓D(zhuǎn)變與 Atf3 表達(dá)變化相關(guān);在小鼠模型中,Atf3 誘導(dǎo)表達(dá)會抑制 Ppargc1a,破壞代謝補(bǔ)償機(jī)制,加速疾病發(fā)展;Atf3 基因敲除對雌性 FS6KD 小鼠有心臟保護(hù)作用,而雄性沒有,這種性別差異可能和性對 Atf3 轉(zhuǎn)錄調(diào)控的影響,或者雄性小鼠其他下游通路因子有關(guān)。
參考文獻(xiàn)
[1]Tasneem Qaqorh et al.,Atf3 controls transitioning in female mitochondrial cardiomyopathy as identified by spatial and single-cell transcriptomics.Sci. Adv.11,eadq1575(2025).DOI:10.1126/sciadv.adq1575.